1. Bonguris: Los Bonguris estarán presentes en el juego. Se trata de frutos parecidos a las Bayas y que sirven para que César te fabrique nuevos tipos de Poké Ball. Tienen en común con las Bayas que se regarán con la Psydugadera, pero en esta ocasión llevarás la plantación contigo en la Caja Bonguris. Además de para fabricar Poké Ball, sirven para mejorar las estadísticas de los Pokémon en el Pokéthlon (Velocidad, Poder, Técnica, Resistencia y Salto) gracias al Agitabonguris.
2. Nuevas Poké Ball: Con estos Bonguris podremos fabricar Poké Ball no vistas desde Oro y Plata originales. Son las siguientes: Amigo Ball, Cebo Ball, Rapid Ball, Luna Ball, Amor Ball, Nivel Ball y Peso Ball. Tienes sus detalles en la página de Poké Ball de Oro y Plata.
3. Rayquaza: Rayquaza sale al nivel 50 teniendo a Groudon y Kyogre, exclusivos de Plata Alma y Oro Corazón respectivamente. Ambos salen al nivel 50 en una cueva.
4. Lugares Confirmados:
   1. Frente Batalla: Se encontrará al oeste de Ciudad Olivo. No se conocen más detalles.
   2. Parque Nacional: En el Parque Nacional seguirá dándose el Concurso de Captura de Bichos, donde debes tratar de capturar el Pokémon Bicho más grande para ganar (en Oro y Plata dependía de sus stats). Tendrá lugar los martes, jueves y sábados y usarás Kompe Balls.
   3. Zona Safari: También se ha confirmado la existencia de una Zona Safari cerca de Ciudad Orquídea. Parece que se podrá diseñar tu propia área de safari y mandársela a tus amigos.
5. Huevo Misterioso: Parece que te volverán a dar un Huevo misterioso. Puede que de él nazca un Togepi.
6. Nuevos juegos de Pokéthlon:
   1. Rompebloques: Tus Pokémon romperán bloques de ladrillo con sus extremidades, con la ayuda de tu stylus.
   2. Relevos: Se trata de una carrera de obstáculos en la que irás controlando a un Pokémon de tu equipo al tiempo.
   3. El Rey del Ring: Se trata de un juego semejante al Ring de Lucha pero controlando a todo tu equipo a la vez para echar a los rivales del ring.

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