La palabra lore creo que se puede parecer más a la palabra japonesa gaiden, o sea, más cercano a la palabra contextualización que a la palabra historia. O sea, vendría a explicar un origen de algo, y esto a veces equivale a "la historia" aunque a veces no.
Para el concepto "tradición o saber popular", creo que sirve la palabra folklore más que lore.
Y por último, lore y plot (argumento) sí que son conceptos diferentes, no creo que ni tenga que molestarme en diferenciar. No es lo mismo el lore de un personaje o un sitio de una historia que el argumento de la historia, de qué trata más que su origen.