Que cada quien lo haga de la forma que más le satisfaga, no es que esto tenga un entramado mayor detrás.
He usado -y elaborado guías- de crianza convencional en las generaciones 4, 5 y 6. He utilizado PokéSav y programas alternativos, dentro del aspecto competitvo, para poder disputar combates rápidos con diferentes equipos sin por ello perder semanas de entrenamiento entre un equipo y el otro, recurrir a tutores de movimiento, etcétera. Nunca miré mal a la gente que con fines competitivos utilizan programas externos para hacerse a su equipo, siempre y cuando sus estadísticas -habilidad y demás parafernaria- sean legales. También he utilizado RNG y tengo cerca de 60 Pokémon Shinys a la par que perfectos XY traídos de BW2.
Actualmente cuando quiero sacar un shiny en Pokémon Y lo hago recurriendo al Método Masuda, a veces no sale tal y como quiero pero para mí, habiendo probado todos los demás métodos, la satisfacción que encuentro en ello es mayor. Como cuando en Monster Hunter te tiras días farmeando un rubí y finalmente te sale xD