Según lo que he leído, si, Lysson es el jefe. Su principal objetivo, a pesar de ser lo que muchos piensan, crear un bello mundo, es en realidad, un acto terrorista. Su plan consiste en crear ''la máxima arma'' para absorber el alma de los pokémon resididos en pokeballs. ¿Cómo lo harán? Aqui entra en medio AZ y su tragica historia:
''Hace 3000, un entrenador tenía un pokémon al que quería mucho. Pero pronto, a su país llegaron guerras. Su pokémon tuvo que partir y falleció en el acto. Con mucho dolor, ese entrenador juro que volvería a ver a su pokémon. Creo una maquina perfecta, que le permitiria revivir a su amigo. Y lo consiguio. Pero el rencor de AZ hacia los enemigos de la guerra, sobrepaso la linea. La maquina, tambien podia convertirse en una terrible arma, que la uso a modo de venganza. El pokemon, lleno de tristeza por el malvado acto de su dueño, le abandono y no volvio nunca más''....
Basicamente, por eso querian las pokeballs, para que lysson consiguiera lo que siempre hubo querido, derrocar a los pokémon