Lo que yo digo es que la Pokédex nacional existe y existirá siempre, del mismo modo que la completa quien quiere. Completarla no te da nada a cambio más que la satisfacción de haberlo hecho y el Amuleto Iris desde 5a gen. Cambiar la obtención del Amuleto Iris a la consecución de la dex nacional es más que suficiente para evitar esas "frustraciones" que decís.
Porque, vamos a ver, y hablando en términos obvios y redundantes: la totalidad de los Pokémon son todos los Pokémon. Hacer un índice parcial y "ocultar" varios de ellos dentro del juego no hace que haya menos Pokémon que conseguir, dificulta su obtención. Y se producen reacciones como la del tarado que dice que le han vendido un juego a trozos. Cada uno juega a Pokémon por lo que le gusta de la franquicia, que son muchas cosas distintas: historia, colección, combates, Pokédex. Y si te quitan algo, siendo eso la razón por la que juegas, entiendo que fastidia.