No estoy seguro, pero puede que los IV y naturaleza estén decididos desde el primer encuentro ^^U
Para confirmarlo, salva la partida en la Cueva y usa la Master Ball y comprueba los IV y Naturaleza, resetea y prueba de nuevo, si sale exactamente igual es que tenía razón ^^U
Entonces la única solución es no salvar hasta verle la undécima y estar en la cueva ^^U