Con naturaleza miedosa adelantas a muchos pokemon que con naturaleza modesta no adelantas.
Ejemplos de pokemon que te adelantan si llevan naturaleza positiva a la velocidad y tu eres modesta:
Salamence, Mew, celebi, victini, landorus-I, garchomp, mienshao, terrakion y el resto de mosqueteros, etc.
Además si te enfrentas a otro gengar, latios/as o espeon es interesante ser más rápido o probablemente pierdas ya que estos pokemon te debilitan de un golpe. Si eres miedoso, como mínimo les empatas a estos, a los anteriores les superas si no boostean su speed o llevan scarf.
Las ventajas de nat. modesta: más poder frente a las walls y etc. (a veces no se necesita la vel.extra de la nat. miedosa).
De todas maneras, mejor miedosa en Gengar. En caso de megaevolucionar hay otros pokemon diferentes a los que adelantar como Starmie (si eres modesta, eres más lento que starmie miedosa siendo megagengar, por ejemplo), pero eso ya es otra historia.