Creo que cronologicamente Kalos se encuentra situada después de Sinnoh por lo que dice la chica que vive junto al anciano de Ciudad Fluxur, el que te cuenta la historia del legendario, la chica dice que tiempo atrás otra Organización le preguntó sobre el Legendario, esa organización seguramente fuera el Eq. Galaxia, ya que los planes de Helio tienen mucho en común con los de Lysson. Por otro lado en B/W volvemos a encontrarnos con el miembro del Team Rocket que encontramos en Kanto tras la derrota del Team Rocket en la Torre de radio de Johto. En B/W2 en la misma casa en la que 2 años antes vivía el miembro del Team Rocket, ahora viven dos antiguos soldados del Eq. Aqua y del Eq. Magma respectivamente, esto situa a Hoenn entre B/W y B/W2. En la Fragata Plasma en B/W2 un recluta nos dice que se unió al Eq. Plasma (Negro) tras haber pertenecido al Eq. Galaxia, pero en ya B/W en el Palacio de N otro recluta nos dice que en otras regiones el Team Rocket y el Eq. Galaxia habían fracasado en sus planes por llamar mucho la atención. En X/Y en un Centro Pokémon un tipo nos dice que ha oído que hace algún tiempo una organización llamada Eq. Plasma la había liado en Teselia.
De este modo situamos la historia de Hoenn entre el transcurso se los 2 años entre B/W y B/W2, al igual que Kalos, ya que en X/Y un tipo nos dice que conoció a Acromo, así que o bien lo conoció antes de B/W2, en cuyo caso Kalos y Hoenn sí transcurren simultáneamente, pero si lo conoció tras B/W2, la historia de Kalos sucedería más o menos un año después que la de Hoenn.
Vale, no se si he aclarado algo o lo he liado más pero espero que haya sido lo 1º xD