Eso eso, hay muchos usuarios de youtube que lo hacen, yo también lo quiero hacer ¿¡Pero como demonios se hace!?
Yo hice una pregunta similar hace unas semanas
Por lo visto gente de Alemania, Estados Unidos y Japón tienen que modificarte la 3DS, (en muchos casos la versión XL no vale) y ya con la modificación interna y unos cables enchufados al PC, hacen posible la grabación
Y ya luego la posterior edición y demás...
...eso sí, cuesta caro y debes enviar TU 3DS o pedir otra nueva ya modificada