Luego se fusionará tus dudas con el de 'Preguntas de Uso Frecuente (F.A.Q) y dudas de Sol y Luna', que es donde debieron ser preguntadas, aquí las respuestas hasta donde se:
-1&2
Hasta donde se, solo el Mew tiene este problema al 100%, ya que solo acepta el EO/ID de los que salieron de Evento, los otros ni idea, no hago estos Glitches, pero lo aconsejable y 'lógico', sería subirlos al nivel que se obtienen posibles en esos juegos para evitar posibles problemas, pero de no haberlos, se podría evitar el subirlos
-3
No lo he probado (porque es irreversible y le quitas la gracia al Amarillo y pierdes el Minijuego), pero diría que no pasa NADA, ya que de pasar, ya se sabría/habría vídeos de Youtube con lo que pasa, así que diría en un 99%, que nada
-4
Esta es fácil, se tienen en cuenta 'los Movesets de Amarillo', es decir, en Amarillo hubo algunas actualizaciones en el aprendizaje de MT/MO en ciertos Pokémon, dos de ellos ya los has dicho tú, Mewtwo aprendía Día de Pago en Rojo y Azul, pero en Amarillo ya no y Charizard solo aprende Vuelo en Amarillo, por lo que como era más probable esto último,s e decidió tener en cuenta el de Amarillo y no el de Rojo/Azul, lo que se traduce en que Mewtwo no puede ser pasado con Día de Pago, de ninguna de las 3 ediciones, ya que con Amarillo es el que cuenta y ahí no se le puede enseñar...
@RagurajiFusionado