Hasta donde tengo entendido no debería darte problemas, puesto que desde la cuarta generación los juegos están diseñados para intercambiar a nivel mundial. Tú piensa que en su día cuando los servidores estaban activos, perfectamente te podías meter en la GTS y recibir un Pikachu japonés sin mayor problema por ejemplo. Y el ser de R4 tampoco debería darte problema tampoco, solo te lo daría a la hora de pasar a un juego de quinta generación, ahí sería otro tema por cómo funciona la Descarga DS.