No creo que hagan eso, sería como matar 3 potenciales eventos que pueden utilizar para su marketing. Además, Deoxys es para Hoenn como Mewtwo para Kanto, entiéndase la analogía.
Tu misma lo has dicho, los eventos currados brillan por su ausencia, ya no se hacen cosas como los 3 nombrados arriba, ahora se lleva el de usarlos como marketing descarado para hacerte ir a una tienda a por un cutre-código para luego recibirlos en el juego de un triste repartidor como si fueran objetos, vamos, marketing basura
, cuando antes era recibir el objeto y buscarlo en el lugar donde vive para enfrentarlo. Ademas, si ocurre un milagro y rescatan los eventos, olvidaros de hacerles shiny hunting, o lo que es lo mismo, estarán mas que capados con un pedazo bloqueo brillante, haciendo que aun tengamos que recurrir a viejos juegos para tener un poke de estos en shiny en lugar de poder usar los juegos actuales que supuestamente son mas "modernos".
Y por cierto, la Isla Suprema con Mew no fue rescatada de Hoenn, y por mucho que venga de esmeralda, Deoxys tampoco aparecía salvaje con un tema propio en RZ, siendo que esto si fue rescatado para los remakes
Sobre todo el de Arceus, al no dar el evento es como si esa parte que programaron no hubiera existido...