Cosas pierde Amarillo frente a Rojo/Azul es el "selector de dificultad" al momento de escoger Starter, los sprites de amarillo me parecen más feos y sin carisma y la verdad que el equipo del rival en Rojo y Azul impone más que el de Amarillo XD.
Otra cosa que tiene Amarillo en contra es que para completar la dex necesitas tanto azul y la roja.
Ergo, la única de amarillo sobre las ediciones originales es el color.
Y entre rojo y azul, depende de si prefieres a Odish o a Bellprout, ekans o sandrew, electabuzz o magmar, etc.