Si solo buscas al Zekrom y te da igual lo demás podrías pedirlo por la GTS. Ofreces algun pokemon valioso que te sobre, pidiendo lo que buscas.
Y si no tienes algo suficientemente valioso, haces cadenas pidiendo cosas aumentando el valor.
Por ejemplo, ofreces un Garchomp o Kingdra, que suelen ser muy buscados, a cambio te dan un Mewtwo o algun legendario de Kalos, que tambien son muy buscados, y luego ofreces este a cambio de Reshiram, ya que los que no tienen XY están mucho mas interesados en los legendarios de Kalos.
Si quieres puedo darte un Zekrom, pero no quiero aprovecharme, ya que el ditto es bastante mas valioso y no cuesta casi nada conseguir legendarios random.
Con este metodo yo ya he llenado casi 4 cajas con legendarios, recomiendo probarlo.