Rubí y Zafiro trajeron una gran cantidad de temas beta, solo por detrás de la siguiente generación. Entre ellos, se puede encontrar una primera versión del de Villa Raíz:
Los siguientes 4 temas son remixes del que suena durante un concurso:
El resto de temas que están ocultos en estas ediciones son versiones de algunos de Oro, Plata y Cristal adaptadas al estilo de la GBA. Seguramente los pusieron ahí para testear las capacidades de la consola que tenían entre manos, y ahí se quedaron:
-Centro Pokémon de Ciudad Trigal (sí, la del Cristal japonés):
-Rutas 38 y 39:
-Combate contra Raikou, Entei y Suicune:
-Ataque del Team Rocket a la Torre Radio:
-Ciudad Verde/Ciudad Plateada/Ciudad Celeste/Ciudad Azafrán/Isla Canela:
RojoFuego y VerdeHoja tienen un único tema oculto, que sería el de curación, pero más al estilo de la primera generación. Como ya sabréis, al final se usó el de Rubí y Zafiro.
En un principio, la música del Esmeralda del combate contra Mew no debería haber ido aquí, pero como a los japoneses no les dio la gana de poner el evento fuera de su país, estamos en las mismas que con el Cristal japonés. Este es su tema: