Yo creo que es como un gran muro "partido en dos" en rubí vemos a Groudon y en zafiro a Kyogre, si ves ambas imágenes juntas da un poco esa sensación.
Ya, como dices, si se junta da esa sensación, si se juntarán las imágenes sería 2 triángulos.
No son dos Rayquaza, solo 1, el mural es distinto en las ediciones, es como si el contrario no existiera en el otro. Es como por ejemplo, en X es como si no existiera Yveltal, y en Y es como si no existiera Xerneas.
Latios y Latias son exclusivos de cada versión igual, entonces en Alfa no existe Latios y en Omega no existe Latias.
Además, en Rubí y Zafiro, Rayquaza no intervenía en nada, ni siquiera se le mencionaba, aunque claro, el remake es un remake de Rubí y Zafiro con cosas del Esmeralda.