Yo veo mas el cambio de generacion mas como una ampliacion de la mecanica del juego añadiendo cosas nuevas que lo vuelve incompatible con los juegos anteriores que un cambio de region. Al fin y al cabo en varias generaciones , debido a los remakes, las formas juegos de regiones dispares, Hoenn-Kanto , Jhoto-Kanto-Shino, Kalos-Hoenn
Precisamente Johto-Kanto, las unicas regiones que tienen relacion entre si, fue un cambio de generacion debido a que se amplio en mucho la mecanica del juego, aun apañandose para hacer los primeros 151 pokemons retrocompatibles con la primera generación
La teoría es interesante PERO, si existieran mas pokemons ocultos en estas versiones ya los hackers lo hubiesen descubierto como ya hicieron con el trío oculto
Lo estas mirando con las limitaciones que habia en DS,donde no podian meter nada nuevo en una generacion si no estaba oculto dentro de los datos del primer juego de dicha generacion.
Esa limitacion ya no existe en 3DS. Los juegos pueden actualizarse. Pueden perfectamente meter un parche 2.0 para incluir los nuevos pokemons en XY, aunque sea solo para luchar contra jugadores con X2/Y2
Una generacion ya no tiene porque estar limitada por sus juegos iniciales. Puede ser ampliada en los nuevos juegos y que los viejos se adapten con actualizaciones. Cuando salga ROZA veremos si lo aprovechan y meten una actualizacion en XY para los nuevos megas o dejan pasar la oportunidad.
En funcion de lo que hagan en ROZA podremos deducir si juegos con nuevos pokemons sera de una nueva generacion o una ampliacion de la sexta