De hecho, es FALSo eso de que la primera vez que losveas se definen sus IVs y Naturaleza. En realidad los datos de esos dos pokemons se definen desde el momento en que liberas el evento para que esten rondando por toda la región, es decir, cuando los liberas en la Burn Tower, a partir de ese momento ya se definieron dichos datos.
Ignoro si estos datos se reinician si los debilitas y esperas a pasar la liga para que se reinicie su ronda por todo Johto, habria que hacer la investigación, pero si es posible, ahi tienes una pequeña oportunidad para resetear sus IVs y Naturaleza.