Bueno, esto es la visión otaku de películas frente a libros.
El centro de la cuestión; ustedes comparan lo malo del anime frente a lo bueno del manga. Así es normal que gane el segundo. Pero claro, no comparamos lo bueno del anime que no hay en el manga.
En primer lugar, el anime suele ser versión original subtitulada (los traducidos, a no ser que sean doblajes que remarquen cosas naturales del idioma original como puede ser la confusión entre nariz y flor que en japonés tienen el mismo fonema, suelen ser muy malos o al menos deficientes). Esto se proyecta con el manga, si está traducido se pueden aclarar algunas dudas típicas de la traducción interpretada, o no. Depende de la editorial y esto es un asunto bastante complejo.
En segundo lugar, el anime suele tener color, normalmente los que el propio autor o autores quieren que tenga. Eso le da una posición bastante relevante frente al manga, donde la mayoría están en blanco y negro. Asimismo, tiene movimiento y sigues las trayectorias de los objetos y demás. En el manga no pasa, por muchos efectos que quieras dibujarle, sigue existiendo la estática propia del papel impreso. Esto suele ser un factor muy importante a lo que quieras más, leer está bien, pero normalmente una película con diálogos orales suele dotarles una cualidad mucho más humanizante que sólo el papel, aunque incluso hablemos de diálogos en lengua extranjera que no entendamos, y debamos ver traducidos para entenderlos.
A lo de que el anime suele ser peor que su versión manga, es discutible. Normalmente imaginamos un arquetipo de historieta más o menos conocida, como puede ser Naruto o Pokémon donde el manga es un millón de veces mejor que el anime (claro, también depende de las intenciones de los que hacen el anime, porque no es lo mismo que hagan un anime y manga para todos los públicos, que por una parte un manga para todos los públicos y un anime descaradamente dirigido hacia niños que no saben ni abrir un Huevo Kinder). Esto último responde al consumismo, porque obviamente si una empresa puede ganar dinero rompiendo un producto original y con el beneplácito del autor, lo hará. Lo que antes equivalía al "buen libro" con una representación en película pésima. Dicho esto, no todo es así. Por ejemplo, Inazuma Eleven tiene un shota anime bastante bueno, pero el manga es pésimo y encima tiene cosas que el anime no tiene (ergo, es más corto). Y los que piensen que Inazuma Eleven es "para niños"... HAH! Es el género Kodomo, así como lo son Shin Chan, Doraemon, Hetalia (a medias, pero bueno) y algunos más, pero no por eso son infantiloides, como creados por Disney Channel, aunque eso es otro asunto. Por ejemplo el manga de Doraemon está muy bien, pero el anime sigue siendo mejor, aunque últimamente lo han dejado bastante enrarecido.
El tema censura se responde desde el párrafo anterior. Si quieren ponerle algo que no es para niños y convertirlo en algo para niños tipo "Boing", censurarán las peleas, si alguno sangra y demás. No se debería, lo que es para niños es para niños, si algo no es para niños no se debe poner. Ni censurar (caso One Piece con Telecinco).
Pueden darse muchos casos donde los mangas sean peores que su posterior representación del anime, pero no podemos hacer generalizaciones indebidas de todo esto. Por tanto no es excusa, y al final los pros de unos igualan a los contras de otros y viceversa, por lo que por último sólo queda la cuestión de gustos, si te gusta más o menos el anime, o si te gusta más o menos el manga.