Cuando pasamos de 24 a 25 en la serie, Anno se salta todos los sucesos desde la muerte de Kaworu hasta que se produce el Tercer Impacto. Durante todo el capítulo 25 y 26 lo que tenemos es el psicoanalisis al que se ven sometidos los personajes al pertenecer a una sola mente, al convertirse en partes de una entidad mayor. Durante este psicoanalisis se da a entender varias veces que la 'Instrumentalización Humana' ha sido completada, siendo deducible (al menos yo lo deducí) que dicha Instrumentalización era conseguir unificar toda la humanidad en una sola entidad. Así mismo, en el capítulo 26, el final da a entender que la decisión de que la humanidad acabe como una entidad o retroceda a antes del Tercer Impacto, recae en Shinji, el cuál tras un examen de conciencia decide que quiere seguir viviendo a pesar de lo difícil que resulta lidiar con la gente, lo que desemboca en la 'burbuja' rompiéndose y la gente felicitando a Shinji en una escena metafórica.
Todo esto ya supone una revolución en el anime, abriendo paso a una gran cantidad de animes con un corte filosófico y maduro que parecían no tener cabida en el mercado pre-Evangelion. Es más, podemos encontrar técnicas narrativas similares a las del capítulo 25 y 26 en animes como Serial Experimental Lain.
Si bien la influencia de Evangelion no se entiende sin The End of Evangelion, película que explica el final, cubriendo el salto temporal desde la muerte de Kaworu hasta el Tercer Impacto y dando un punto de vista más entendible sobre la Instrumentalización, también creo que Evangelion habría perdido mucho de no tener un final tan polémico y magnífico como el original.