Madoka Kaname (鹿目 まどか)
La protagonista. Una chica de catorce años, con una familia que la quiere, grandes amigos, una vida perfecta y que se preocupa mucho por los demás. Las cosas empezarán a cambiar cuando conoce a Homura, una chica nueva de su clase y a Kyubey y recibe la oferta de convertirse en chica mágica.
Sayaka Miki (美樹 さやか)Mejor amiga de Madoka. Ella recibe la oferta (junto con Madoka) de convertirse en una chica mágica. Se preocupa mucho por sus amigos y quiere ayudar a un chico, del que está enamorada, debido a que se encuentra en el hospital tras haber sufrido un terrible accidente.
Akemi Homura (暁美 ほむら)Chica misteriosa que Madoka conoce por que llega a su clase como alumna de intercambio en medio del curso. Es una chica mágica que trata de impedir que Madoka acepte el contrato.
Tomoe Mami (巴 マミ)Chica mágica que se encuentra con Madoka y con Miki tras salvar a Kyubey de un desafortunado incidente. Es un año mayor que ellas y es la que les explica el trabajo de una chica mágica, además de llevarlas con ella en su trabajo.
Sakura Kyoko (佐倉 杏子)Chica mágica que trata de tener como área la ciudad en la que vive Madoka. Se enfrenta con Miki y su objetivo no es claro.
Kyubey (キュゥべえ)Criatura mágica con el poder de conceder deseos a cambio de que la chica que acepta se convierta en chica mágica. Tiene un aspecto "adorable" pero a lo largo de la historia se conocerá su objetivo real y como "se preocupa" por las chicas mágicas.