Yo he usado muchas veces la GTS y nunca me ha pasado, pero aun asi, el Entei era tuyo o de otra persona? Si era de otra persona podria estar modificado y si no sera un fallo de la GTS, yo que tu volveria a mirar mañana o pasado, he leido que a veces los pokemon desaparecen temporalmente, quiza te lo hayan intercambiado o vuelva a aprecer ahi, intentalo por si acaso.
Suerte con el problema.