Cuenta una leyenda que un huevo habitó en la nada cuando aún no existía el universo. Al eclosionar este, nació de él Arceus, considerado el Pokémon creador.
Lo primero que hizo fue crear un pokemon que recogiera todos los ADN de todos los pokemons que creara, a dicho pokemon lo llamo Mew, y fue el primer pokemon creado por Arceus. Después creó a Palkia que dió origen al espacio y las dimensiones. Tuvo que crear después a Dialga, que a su vez dió origen al tiempo haciéndolo avanzar desde su nacimiento. Mas tarde creo a Giratina, que era muy violento. Así que fue desterrado al Mundo Distorsión (una dimensión paralela que equilibra nuestra realidad) para que no causara mas daños. Después creo la oscuridad y la luz representadas por Darkrai y Cresselia respectivamente.
Arceus necesitaba un lugar en el que colocar a los pokemons comunes, asique creo lo que ahora llamamos La Tierra. La Tierra era un lugar vacio, uniforme. Asique creo a Kiogre y a Groudon para que crearan el agua y la tierra respectivamente. Dado que La Tierra es limitada, pronto se lleno océanos y continentes, pero como ya no quedaba más espacio, Groudon y Kyogre se pelearon por conquistar el planeta. Como esos dos Pokémon eran muy fuertes, y podían llegar a destruir el planeta, Arceus creo a Rayquaza, que tenia el don de controlar a estos dos pokemons y de crear el cielo.
Arceus creo a Regigigas para que ayudara a Groudon a mover los continentes, y a su vez, éste creo a otros tres pokemons: Regirock, Regice y Registeel para que ayudaran a cuidar La Tierra. Algunos volcanes surgieron, pero ninguno era capaz de controlarlos, asique Arceus creo a Heatran, un pokemon capaz de manejar el magma de la tierra.
Posteriormente, Arceus creo a Manaphy para cuidar a los océanos, ya que Kyogre sólo los creaba, y a sus Pokémon habitantes (Omanyte, Omastar, Kabuto, Kabutops, algunos Magikarp y Gyarados gigantes) como era una tarea muy dificil creo a Phione para que lo ayudara en esta labor.
En tierra firme se creo a Shaymin para que la naturaleza existiera, también creó a Celebi con el don de viajar en el tiempo para que creara las estaciones del año, cuidando y guardando así la naturaleza que Shaymin creó.
Más tarde, Arceus creó a Lugia y a Ho-Oh, que son la representación de la vida del Sol y la Luna. Necesitaba un guarduan La Luna, un asteroide vacio, asique creo a Deoxys. Después Lugia creó a los Pokémon controladores del aire, las tres aves legendarias: Articuno el ave controlador del frío, Zapdos el ave controlador de las tormentas y Moltres el ave controlador del calor.
Ya con la Tierra terminada, Arceus creo al resto de pokemons y a los humanos. A los humanos les faltaba algo, estaban vacios, le faltaban los sentimientos. Asique Arceus creo al trio legendario formado por Uxie, Mesprit y Azelf que se encargaron de darle a los humanos sentimientos como la emoción, la sabiduría y la voluntad, características básicas que representan a cada uno de ellos respectivamente.
Posteriormente creó a Jirachi que puso las estrellas en el firmamento, y éste más tarde quiso conceder a personas y Pokémon sus afables deseos si el cometa milenario era visto por ellos. Arceus les dio como obsequio a los humanos a Latios y Latias para que buscasen a personas de buen corazón y para protegerlas de las catástrofes naturales.
Tiempo despues los humanos hicieron un edificio como lugar de culto al pokemon legendario Ho-Oh, la Torre Laton, en la que vivio Ho-Oh hasta que un incendio quemo dicho lugar. Allí tres inocentes Pokémon quedaron atrapados entre las llamas, y lamentablemente perecieron. Ho-Oh se dio cuenta de esto, y con sus milagrosos poderes les regaló nuevas vidas, dándoles increíbles poderes. Desde ese momento fueron conocidos como: Raikou,la Personificación del Trueno; Entei,la Personificación del Fuego; Suicune,la Personificación de los Vientos del Norte.
La leyenda continúa y cuenta que una vez creados los Pokémon y el universo, Arceus se trasladó a su propia dimensión donde descansa para recuperar el poder perdido por la creación, aunque puede ser invocado en un lugar llamado Sala del Origen, en lo más alto de unas ruinas del Monte Corona, o en el Arbol de la vida.
Y sólo saldría cuando el universo corriese grave peligro.
