La Navel Rock, se encuentra en medio de la Isla 4 y 5.

La isla de Deoxys se encuentra después de la 7

La isla de Mew se supone que se enuentra en las orillas maritimas entre Kanto, Johto y Hoenn. (Muy lejos pero pertenece a Hoenn y a Johto al mismo tiempo)
Teoria: Si Hoenn te permite ir tanto a Navel Rock Island (Lugia & Ho-Oh) y a Birth Island (Deoxys), entonces nos permitirían ir a todas las Sevii Islands.

Por ende Podríamos ir a Kanto y después a Johto.
(Está ultima apuesta, no la hago. Solo ando teorizando con el Mapa)
Dudo mucho que Game Freak nos permita ir a otra región pero sería muy agradable tener los antiguos eventos de Emerald.
Teoría Regional:Hoenn se encuentra al sur e invertido donde Arrecípolis (Sootopolis City) se encuentra y apunta al Norte donde a unos kilometros más al norte se encuentran las Sevii Islands (Islas Sete) que te permiten viajar todavía más al norte donde podremos ir a Kanto y una vez ahí, viajar al Oeste para poder llegar a Johto.
Posibles Límites Nauticos:
Límite de Kanto Rojo
Límite de Hoenn Verde
Tampocó hay que olvidar que Cronológicamente hablando, los acontecimientos de Hoeen pasaron al mismo tiempo que los acontecimientos de Kanto.
Eso explicaría porque encontramos a Lugia y a Ho-Oh en la Navel Rock, ya que esta se hundió 2 años después y fue así como Lugia y Ho-Oh se mudaron a Johto.
Los límites náuticos también explican porque no podemos conseguir a Latios y a Latias en FireRed y en LeafGreen. Pero en FR y en LG si podemos conseguir a Lugia, Ho-OH y a Deoxys.
Mew
Lugia
Ho-Oh
Latias
Latios
Deoxys
Actualizaciones:
-Se actualizo la imagen, olvide poner a Latios y Latias en el Mapa
-Se actualizaron los límites Náuticos
-Se agregáron videos de Eventos Legendarios