Madoka Kaname (鹿目 まどか)
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La protagonista. Una chica de catorce años, con una familia que la quiere, grandes amigos, una vida perfecta y que se preocupa mucho por los demás. Las cosas empezarán a cambiar cuando conoce a Homura, una chica nueva de su clase y a Kyubey y recibe la oferta de convertirse en chica mágica.
Sayaka Miki (美樹 さやか)
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Mejor amiga de Madoka. Ella recibe la oferta (junto con Madoka) de convertirse en una chica mágica. Se preocupa mucho por sus amigos y quiere ayudar a un chico, del que está enamorada, debido a que se encuentra en el hospital tras haber sufrido un terrible accidente.
Akemi Homura (暁美 ほむら)
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Chica misteriosa que Madoka conoce por que llega a su clase como alumna de intercambio en medio del curso. Es una chica mágica que trata de impedir que Madoka acepte el contrato.
Tomoe Mami (巴 マミ)
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Chica mágica que se encuentra con Madoka y con Miki tras salvar a Kyubey de un desafortunado incidente. Es un año mayor que ellas y es la que les explica el trabajo de una chica mágica, además de llevarlas con ella en su trabajo.
Sakura Kyoko (佐倉 杏子)
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Chica mágica que trata de tener como área la ciudad en la que vive Madoka. Se enfrenta con Miki y su objetivo no es claro.
Kyubey (キュゥべえ)
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Criatura mágica con el poder de conceder deseos a cambio de que la chica que acepta se convierta en chica mágica. Tiene un aspecto "adorable" pero a lo largo de la historia se conocerá su objetivo real y como "se preocupa" por las chicas mágicas.