No es cierto que se te pete la partida, verás, hay muchos tipos de Missingno.
El más común e inofensivo es el "MISSINGNO" original, si lo capturas probablemente haya fallos en tu partida pero no se perderán los datos, eso te lo aseguro.
Otro, tal vez menos inofensivo, es el "3TRAINERPOKÉ", no se sabe muy bien qué es, pero es causado (según alguna gente) por luchar contra un entrenador cuando se trata de un Pokémon salvaje.
Otro, que no entra en la categoría de Missigno's, es el huevo MALO, se ha visto en estos juegos:
R/Z/E, RF/VH, D/P/Pt e inclusive Pokémon Battle Revolution, en este sale solamente si se incluyen Pokémon Ubers o editados por Pokésav con stats muy altos (sobre los 255 EV) en las cajas.
El más peligroso es el conocido como " 'M ", si incluyes a 'M en tu equipo hay muy pocas probabilidades de que tu partida siga con vida cuando la reanudes.
Estos son los tipos conocidos de Errores más comunes, luego está el Mew de Islas Virus/Fallo/Glitch.
Personalmente, nunca he tenido ocasión de ver a algún Missingno en D/P/Pt, HG/SS salvaje, probablemente el problema se haya solucionado.