Básicamente, al menos en mi caso, porque Toon Link ya ha salido en anteriores entregas, y la gente quiere cosas nuevas, aunque lo mejor sería simplemente incluir a los dos.
Es cierto que no tiene demasiada relevancia en cuanto a la saga Zelda en general ya que sale solamente en uno de sus muchos juegos, pero a mi me gustó mucho como personaje en el Majora's Mask de N64!
Pues en mi opinión toda saga tiene un límite de personajes de mayor importancia e incluir a más sería demasiado, para Super Mario: Mario, Peach, Bowser y Wegee, me parece hasta excesivo tener a Yoshi y a Wario pero ya que están no los vamos a quitar. Para Zelda: Link, Zelda y Ganondorf deberían de ser ya suficientes, aunque por lo visto para Sakurai la linea temporal del Wind Waker es igual de importante y decidió poner a T.Link con lo cual no me puedo quejar porque me encanta, sabiendo que también quería tener a Toon Zelda y Toon Ganondorf en Brawl no veo razón por la que al menos Toon Link no aparezca en este.
Ante todo, preferiría tener newcomers de otras IPs antes que incluir a otro de las más populares que realmente no lo necesitan como por ejemplo: Hans(Isaac) de Golden Sun, Shulk de Xenoblade, Palutena para Kid Icarus, Villager(que ya entró) de Animal Crossing, Megaman etc.