Es dependiendo el uso que se les de, por ejemplo yo eh alterado pokemons para tener un zapdos que es mi pokemon favorito o un pikachu nivel 100, por que extrañaba mi pikachu de mi versión amarilla jaja, no creo que haya ningún problema si tu intención es coleccionar, pero si vas a competir enserio y no me refiero a una pelea entre amigos, sino en un torneo o algo mas serio, si considero poco ético utilizar pokemons alterados, pero igual es aceptable, siempre y cuando sea un poco en regla, no overpower, yo tengo amigos que han jugado pokemon por los últimos 8 años, si hackean un pokemon y lo usan para pelear, cual es el problema? dejara de ser un buen entrenador? creo que no, sin embargo si un novato hackea un pokemon, lo hace shiny con ataques imposibles y EVs al maximo y lo usa para competir, ahi si veo un problema.
En pocas palabras, debe de haber libertad, hasta el punto donde no afectes a nadie, no me parece que quiten el hackeo, por que no debería de tener mi zapdos o los pokemons con los que creci? estoy de acuerdo que una persona que entrena a sus pokemons vale mas que uno hackeado, y lo digo por experiencia, cuando consigo un pokemon alterado no es lo mismo que entrenar a un zapdos o mi jolteon que tanto quiero, y si en algo estoy de acuerdo con los que quieren prohibir el alteramiento es que un pokemon tiene mas merito cuando se entrena, pero hasta ahí.