Fundamentalmente tu lo se lo equipas a uno de los dos padres, entonces con ello te aseguras que de las 6 IV que hay 5 se eligan entre los dos valores que hay de cada una de ellas de los padres.
Mi consejo es que a Ditto sólo lo utilices en las fases iniciales y que posteriormente cuando puedas lo sustituyas por ese pokemon u otro del mismo grupo huevo (si es macho) con mayores IV, de forma que las crías tengan mayores posibilidades de coger mejores IV y no tengas que depender tantísimo del aleatorio. Sobre la sexta como dicen es tener suerte de que aleatoriamente sea top.